Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX25Q9UHL0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms