Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms