Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK1NQ9UHG2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1NQ9UHG2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK1NQ9UHG2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK1NQ9UHG2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms