Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGXB4Q9UGU5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms