Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM10Q9UDY6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.9 ms