Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRPC4Q9UBN4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC4Q9UBN4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms