Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT4Q9P109 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCNT4Q9P109 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms