Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4Q9P0V3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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