Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BICRAQ9NZM4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
BICRAQ9NZM4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
BICRAQ9NZM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms