Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DLL3Q9NYJ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DLL3Q9NYJ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms