Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC10Q9NYD6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms