Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VNN3Q9NY84 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms