Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30AQ9NV96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms