Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDFIP2Q9NV92 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDFIP2Q9NV92 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms