Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNTG1Q9NSN8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms