Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SERINC1Q9NRX5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SERINC1Q9NRX5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms