Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms