Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRMS1Q9HCU9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms