Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLD4Q9HCU8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms