Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP29Q9HBJ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms