Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COG4Q9H9E3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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