Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFSD1Q9H3U5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD1Q9H3U5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD1Q9H3U5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD1Q9H3U5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFSD1Q9H3U5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD1Q9H3U5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MFSD1Q9H3U5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms