Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZYG11BQ9C0D3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZYG11BQ9C0D3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZYG11BQ9C0D3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZYG11BQ9C0D3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZYG11BQ9C0D3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms