Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHACTR1Q9C0D0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHACTR1Q9C0D0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms