Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms