Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAPERQ9BY12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
SCAPERQ9BY12 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms