Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms