Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTDSS2Q9BVG9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms