Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAGR1Q9BTK6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAGR1Q9BTK6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAGR1Q9BTK6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms