Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms