Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY3Q9BT09 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY3Q9BT09 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms