Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms