Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM47Q9BQJ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM47Q9BQJ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms