Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP19Q99542 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms