Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPG4P5Q96PW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms