Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP3Q96P20 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP3Q96P20 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms