Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP57Q96MR6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP57Q96MR6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms