Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERAC1Q96JX3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms