Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC41A2Q96JW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms