Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGBD1Q96JS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms