Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A4AQ96JQ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms