Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms