Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAMP1Q96JM3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms