Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BORCS6Q96GS4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms