Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK4Q96C45 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK4Q96C45 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK4Q96C45 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ULK4Q96C45 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms