Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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