Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms