Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms