Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-CQ95604 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-CQ95604 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms