Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXT2Q93063 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXT2Q93063 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms